Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS4P35443 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS4P35443 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS4P35443 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS4P35443 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS4P35443 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS4P35443 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS4P35443 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS4P35443 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS4P35443 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS4P35443 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS4P35443 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS4P35443 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS4P35443 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS4P35443 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
THBS4P35443 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS4P35443 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS4P35443 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS4P35443 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS4P35443 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS4P35443 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS4P35443 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS4P35443 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS4P35443 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS4P35443 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS4P35443 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS4P35443 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS4P35443 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS4P35443 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS4P35443 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS4P35443 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS4P35443 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS4P35443 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS4P35443 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS4P35443 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS4P35443 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS4P35443 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS4P35443 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS4P35443 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS4P35443 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS4P35443 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS4P35443 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS4P35443 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS4P35443 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS4P35443 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS4P35443 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS4P35443 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS4P35443 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
THBS4P35443 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
THBS4P35443 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS4P35443 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS4P35443 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS4P35443 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS4P35443 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS4P35443 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS4P35443 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS4P35443 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS4P35443 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS4P35443 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THBS4P35443 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THBS4P35443 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS4P35443 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS4P35443 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS4P35443 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS4P35443 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS4P35443 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS4P35443 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS4P35443 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS4P35443 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS4P35443 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS4P35443 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS4P35443 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS4P35443 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS4P35443 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS4P35443 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS4P35443 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS4P35443 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS4P35443 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS4P35443 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS4P35443 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS4P35443 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS4P35443 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS4P35443 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS4P35443 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
THBS4P35443 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS4P35443 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS4P35443 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS4P35443 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS4P35443 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS4P35443 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS4P35443 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THBS4P35443 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THBS4P35443 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THBS4P35443 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS4P35443 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS4P35443 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS4P35443 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS4P35443 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS4P35443 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS4P35443 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms