Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORAP35398 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RORAP35398 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORAP35398 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RORAP35398 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RORAP35398 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RORAP35398 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RORAP35398 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RORAP35398 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RORAP35398 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RORAP35398 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORAP35398 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RORAP35398 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORAP35398 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORAP35398 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORAP35398 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORAP35398 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORAP35398 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORAP35398 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORAP35398 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RORAP35398 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RORAP35398 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RORAP35398 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORAP35398 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORAP35398 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORAP35398 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORAP35398 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORAP35398 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORAP35398 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORAP35398 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORAP35398 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORAP35398 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORAP35398 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORAP35398 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORAP35398 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORAP35398 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RORAP35398 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORAP35398 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RORAP35398 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RORAP35398 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RORAP35398 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RORAP35398 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RORAP35398 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RORAP35398 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RORAP35398 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RORAP35398 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RORAP35398 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RORAP35398 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RORAP35398 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RORAP35398 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RORAP35398 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RORAP35398 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RORAP35398 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RORAP35398 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RORAP35398 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RORAP35398 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RORAP35398 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RORAP35398 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RORAP35398 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RORAP35398 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RORAP35398 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RORAP35398 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RORAP35398 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RORAP35398 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RORAP35398 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORAP35398 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORAP35398 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORAP35398 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORAP35398 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORAP35398 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORAP35398 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORAP35398 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORAP35398 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORAP35398 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORAP35398 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RORAP35398 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RORAP35398 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORAP35398 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORAP35398 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORAP35398 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORAP35398 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORAP35398 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORAP35398 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORAP35398 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORAP35398 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORAP35398 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORAP35398 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORAP35398 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORAP35398 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RORAP35398 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORAP35398 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORAP35398 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORAP35398 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RORAP35398 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RORAP35398 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RORAP35398 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RORAP35398 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RORAP35398 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORAP35398 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RORAP35398 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms