Protein–RNA interactions for Protein: P30939

HTR1F, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1FP30939 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1FP30939 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1FP30939 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1FP30939 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1FP30939 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR1FP30939 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1FP30939 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1FP30939 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1FP30939 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1FP30939 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR1FP30939 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR1FP30939 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms