Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC27P30260 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC27P30260 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC27P30260 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC27P30260 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC27P30260 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC27P30260 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC27P30260 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC27P30260 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC27P30260 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC27P30260 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC27P30260 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC27P30260 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC27P30260 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC27P30260 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC27P30260 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC27P30260 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC27P30260 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC27P30260 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC27P30260 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC27P30260 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC27P30260 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC27P30260 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC27P30260 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC27P30260 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC27P30260 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC27P30260 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC27P30260 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC27P30260 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC27P30260 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC27P30260 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC27P30260 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC27P30260 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC27P30260 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC27P30260 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC27P30260 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC27P30260 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC27P30260 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC27P30260 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC27P30260 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC27P30260 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC27P30260 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC27P30260 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC27P30260 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC27P30260 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC27P30260 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC27P30260 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC27P30260 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC27P30260 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC27P30260 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC27P30260 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC27P30260 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC27P30260 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC27P30260 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC27P30260 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC27P30260 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC27P30260 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC27P30260 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC27P30260 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC27P30260 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC27P30260 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC27P30260 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC27P30260 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC27P30260 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC27P30260 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC27P30260 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC27P30260 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC27P30260 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC27P30260 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC27P30260 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC27P30260 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC27P30260 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC27P30260 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC27P30260 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC27P30260 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC27P30260 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC27P30260 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC27P30260 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC27P30260 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC27P30260 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC27P30260 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC27P30260 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC27P30260 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC27P30260 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC27P30260 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC27P30260 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC27P30260 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms