Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MARCKSP29966 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCKSP29966 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MARCKSP29966 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MARCKSP29966 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms