Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VARSP26640 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VARSP26640 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VARSP26640 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VARSP26640 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VARSP26640 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VARSP26640 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VARSP26640 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VARSP26640 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VARSP26640 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VARSP26640 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VARSP26640 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VARSP26640 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VARSP26640 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VARSP26640 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VARSP26640 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VARSP26640 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VARSP26640 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VARSP26640 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VARSP26640 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VARSP26640 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VARSP26640 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VARSP26640 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VARSP26640 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VARSP26640 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VARSP26640 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VARSP26640 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VARSP26640 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VARSP26640 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VARSP26640 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VARSP26640 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VARSP26640 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VARSP26640 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VARSP26640 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VARSP26640 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VARSP26640 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VARSP26640 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VARSP26640 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VARSP26640 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VARSP26640 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VARSP26640 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VARSP26640 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VARSP26640 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VARSP26640 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VARSP26640 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VARSP26640 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VARSP26640 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VARSP26640 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VARSP26640 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VARSP26640 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VARSP26640 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VARSP26640 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VARSP26640 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VARSP26640 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VARSP26640 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VARSP26640 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VARSP26640 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VARSP26640 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VARSP26640 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VARSP26640 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VARSP26640 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VARSP26640 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VARSP26640 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VARSP26640 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VARSP26640 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VARSP26640 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VARSP26640 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VARSP26640 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VARSP26640 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VARSP26640 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VARSP26640 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VARSP26640 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VARSP26640 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VARSP26640 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VARSP26640 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VARSP26640 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VARSP26640 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VARSP26640 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VARSP26640 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VARSP26640 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VARSP26640 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VARSP26640 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VARSP26640 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VARSP26640 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VARSP26640 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VARSP26640 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VARSP26640 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VARSP26640 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VARSP26640 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VARSP26640 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VARSP26640 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VARSP26640 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VARSP26640 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VARSP26640 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VARSP26640 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VARSP26640 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VARSP26640 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VARSP26640 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms