Protein–RNA interactions for Protein: P25846

MSH1, DNA mismatch repair protein MSH1, mitochondrial, yeastyeast

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Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH1P25846 MFG1YDL233W 1377 nt7.45□□□□□ -1.22
MSH1P25846 SNU71YGR013W 1863 nt7.45□□□□□ -1.22
MSH1P25846 ARP3YJR065C 1350 nt7.45□□□□□ -1.22
MSH1P25846 PHO3YBR092C 1404 nt7.44□□□□□ -1.22
MSH1P25846 HAC1YFL031W 717 nt7.44□□□□□ -1.22
MSH1P25846 RGD2YFL047W 2145 nt7.44□□□□□ -1.22
MSH1P25846 PNS1YOR161C 1620 nt7.44□□□□□ -1.22
MSH1P25846 CIT3YPR001W 1461 nt7.43□□□□□ -1.22
MSH1P25846 SKP1YDR328C 585 nt7.43□□□□□ -1.22
MSH1P25846 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.42□□□□□ -1.22
MSH1P25846 PRE5YMR314W 705 nt7.42□□□□□ -1.22
MSH1P25846 CMK2YOL016C 1344 nt7.42□□□□□ -1.22
MSH1P25846 TUF1YOR187W 1314 nt7.42□□□□□ -1.22
MSH1P25846 HSM3YBR272C 1443 nt7.42□□□□□ -1.22
MSH1P25846 HPT1YDR399W 666 nt7.41□□□□□ -1.22
MSH1P25846 SLA2YNL243W 2907 nt7.41□□□□□ -1.22
MSH1P25846 YLR358CYLR358C 564 nt7.4□□□□□ -1.22
MSH1P25846 PEX31YGR004W 1389 nt7.4□□□□□ -1.22
MSH1P25846 FCY22YER060W-A 1593 nt7.4□□□□□ -1.22
MSH1P25846 MSG5YNL053W 1470 nt7.39□□□□□ -1.23
MSH1P25846 YJL211CYJL211C 444 nt7.39□□□□□ -1.23
MSH1P25846 DSC3YOR223W 879 nt7.39□□□□□ -1.23
MSH1P25846 DAL7YIR031C 1665 nt7.38□□□□□ -1.23
MSH1P25846 PPH22YDL188C 1134 nt7.38□□□□□ -1.23
MSH1P25846 AVT4YNL101W 2142 nt7.38□□□□□ -1.23
MSH1P25846 SDH8YBR269C 417 nt7.38□□□□□ -1.23
MSH1P25846 MHP1YJL042W 4197 nt7.38□□□□□ -1.23
MSH1P25846 BIM1YER016W 1035 nt7.37□□□□□ -1.23
MSH1P25846 NAF1YNL124W 1479 nt7.36□□□□□ -1.23
MSH1P25846 NOG2YNR053C 1461 nt7.36□□□□□ -1.23
MSH1P25846 DMC1YER179W 1005 nt7.36□□□□□ -1.23
MSH1P25846 AIM33YML087C 939 nt7.36□□□□□ -1.23
MSH1P25846 ARO7YPR060C 771 nt7.36□□□□□ -1.23
MSH1P25846 ADH5YBR145W 1056 nt7.36□□□□□ -1.23
MSH1P25846 SMC5YOL034W 3282 nt7.36□□□□□ -1.23
MSH1P25846 ARG81YML099C 2643 nt7.35□□□□□ -1.23
MSH1P25846 EEB1YPL095C 1371 nt7.35□□□□□ -1.23
MSH1P25846 CRN1YLR429W 1956 nt7.35□□□□□ -1.23
MSH1P25846 PAC2YER007W 1557 nt7.35□□□□□ -1.23
MSH1P25846 CCW12YLR110C 402 nt7.35□□□□□ -1.23
MSH1P25846 RPL43AYPR043W 279 nt7.35□□□□□ -1.23
MSH1P25846 EHD3YDR036C 1503 nt7.35□□□□□ -1.23
MSH1P25846 KNS1YLL019C 2214 nt7.34□□□□□ -1.23
MSH1P25846 YCR049CYCR049C 447 nt7.34□□□□□ -1.23
MSH1P25846 STS1YIR011C 960 nt7.34□□□□□ -1.23
MSH1P25846 HAL5YJL165C 2568 nt7.34□□□□□ -1.23
MSH1P25846 OSM1YJR051W 1506 nt7.33□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YJR107WYJR107W 987 nt7.32□□□□□ -1.24
MSH1P25846 HMS2YJR147W 1077 nt7.32□□□□□ -1.24
MSH1P25846 HEL1YKR017C 1656 nt7.32□□□□□ -1.24
MSH1P25846 PET117YER058W 324 nt7.31□□□□□ -1.24
MSH1P25846 SHO1YER118C 1104 nt7.31□□□□□ -1.24
MSH1P25846 TOM20YGR082W 552 nt7.31□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YJL144WYJL144W 315 nt7.31□□□□□ -1.24
MSH1P25846 ERV2YPR037C 591 nt7.31□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YBR226CYBR226C 411 nt7.31□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YEN1YER041W 2280 nt7.31□□□□□ -1.24
MSH1P25846 CIR2YOR356W 1896 nt7.3□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YUR1YJL139C 1287 nt7.3□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YLR122CYLR122C 378 nt7.3□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YNL200CYNL200C 741 nt7.3□□□□□ -1.24
MSH1P25846 CDC16YKL022C 2523 nt7.29□□□□□ -1.24
MSH1P25846 SWP1YMR149W 861 nt7.29□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YPL247CYPL247C 1572 nt7.29□□□□□ -1.24
MSH1P25846 ISC1YER019W 1434 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YPR204WYPR204W 3099 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH1P25846 DPH5YLR172C 903 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YML079WYML079W 606 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH1P25846 TOS6YNL300W 309 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH1P25846 RBS1YDL189W 1374 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH1P25846 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.27□□□□□ -1.25
MSH1P25846 YNL017CYNL017C 339 nt7.27□□□□□ -1.25
MSH1P25846 MSI1YBR195C 1269 nt7.27□□□□□ -1.25
MSH1P25846 YGL081WYGL081W 963 nt7.26□□□□□ -1.25
MSH1P25846 TPK1YJL164C 1194 nt7.26□□□□□ -1.25
MSH1P25846 YJR142WYJR142W 1029 nt7.26□□□□□ -1.25
MSH1P25846 NPL6YMR091C 1308 nt7.26□□□□□ -1.25
MSH1P25846 ICS3YJL077C 396 nt7.25□□□□□ -1.25
MSH1P25846 CUE4YML101C 354 nt7.25□□□□□ -1.25
MSH1P25846 RPR1RPR1 369 nt7.25□□□□□ -1.25
MSH1P25846 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.25□□□□□ -1.25
MSH1P25846 CEF1YMR213W 1773 nt7.25□□□□□ -1.25
MSH1P25846 TKL2YBR117C 2046 nt7.25□□□□□ -1.25
MSH1P25846 SES1YDR023W 1389 nt7.24□□□□□ -1.25
MSH1P25846 TRS31YDR472W 852 nt7.24□□□□□ -1.25
MSH1P25846 PIH1YHR034C 1035 nt7.24□□□□□ -1.25
MSH1P25846 CBR1YIL043C 855 nt7.24□□□□□ -1.25
MSH1P25846 PEX13YLR191W 1161 nt7.24□□□□□ -1.25
MSH1P25846 ATP23YNR020C 813 nt7.24□□□□□ -1.25
MSH1P25846 MIP1YOR330C 3765 nt7.23□□□□□ -1.25
MSH1P25846 PUP2YGR253C 783 nt7.23□□□□□ -1.25
MSH1P25846 CIS3YJL158C 684 nt7.23□□□□□ -1.25
MSH1P25846 PZF1YPR186C 1290 nt7.23□□□□□ -1.25
MSH1P25846 GFA1YKL104C 2154 nt7.23□□□□□ -1.25
MSH1P25846 RAP1YNL216W 2484 nt7.23□□□□□ -1.25
MSH1P25846 BUD9YGR041W 1644 nt7.23□□□□□ -1.25
MSH1P25846 ELP3YPL086C 1674 nt7.22□□□□□ -1.25
MSH1P25846 HRB1YNL004W 1365 nt7.22□□□□□ -1.25
MSH1P25846 ORM1YGR038W 669 nt7.22□□□□□ -1.25
MSH1P25846 NCA3YJL116C 1014 nt7.22□□□□□ -1.25
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