Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP24386 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP24386 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP24386 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP24386 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP24386 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP24386 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP24386 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP24386 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP24386 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP24386 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP24386 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP24386 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP24386 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP24386 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP24386 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP24386 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP24386 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP24386 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP24386 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP24386 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP24386 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP24386 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP24386 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP24386 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP24386 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP24386 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP24386 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP24386 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP24386 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP24386 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP24386 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP24386 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP24386 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP24386 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP24386 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP24386 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP24386 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP24386 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP24386 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP24386 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP24386 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP24386 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP24386 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP24386 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP24386 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP24386 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP24386 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP24386 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP24386 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP24386 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP24386 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP24386 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP24386 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP24386 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP24386 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP24386 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP24386 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP24386 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP24386 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP24386 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP24386 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP24386 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP24386 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP24386 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP24386 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP24386 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP24386 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP24386 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP24386 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP24386 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP24386 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP24386 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP24386 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP24386 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP24386 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP24386 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms