Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAX3P23760 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PAX3P23760 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAX3P23760 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAX3P23760 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PAX3P23760 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAX3P23760 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAX3P23760 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAX3P23760 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAX3P23760 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAX3P23760 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAX3P23760 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAX3P23760 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAX3P23760 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAX3P23760 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAX3P23760 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAX3P23760 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAX3P23760 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAX3P23760 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAX3P23760 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAX3P23760 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAX3P23760 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PAX3P23760 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAX3P23760 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAX3P23760 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PAX3P23760 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAX3P23760 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAX3P23760 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PAX3P23760 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX3P23760 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAX3P23760 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAX3P23760 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAX3P23760 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAX3P23760 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAX3P23760 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAX3P23760 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAX3P23760 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PAX3P23760 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAX3P23760 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAX3P23760 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAX3P23760 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PAX3P23760 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAX3P23760 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PAX3P23760 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAX3P23760 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAX3P23760 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX3P23760 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX3P23760 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX3P23760 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX3P23760 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX3P23760 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX3P23760 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAX3P23760 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAX3P23760 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PAX3P23760 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAX3P23760 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAX3P23760 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAX3P23760 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAX3P23760 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAX3P23760 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAX3P23760 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAX3P23760 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAX3P23760 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAX3P23760 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAX3P23760 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAX3P23760 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAX3P23760 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAX3P23760 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAX3P23760 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAX3P23760 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAX3P23760 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAX3P23760 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAX3P23760 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAX3P23760 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAX3P23760 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAX3P23760 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAX3P23760 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAX3P23760 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAX3P23760 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAX3P23760 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAX3P23760 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAX3P23760 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAX3P23760 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAX3P23760 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAX3P23760 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAX3P23760 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAX3P23760 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAX3P23760 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAX3P23760 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAX3P23760 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms