Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
JAK1P23458 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
JAK1P23458 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JAK1P23458 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JAK1P23458 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JAK1P23458 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JAK1P23458 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JAK1P23458 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JAK1P23458 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JAK1P23458 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JAK1P23458 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JAK1P23458 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
JAK1P23458 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JAK1P23458 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JAK1P23458 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
JAK1P23458 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JAK1P23458 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JAK1P23458 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
JAK1P23458 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAK1P23458 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAK1P23458 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAK1P23458 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
JAK1P23458 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
JAK1P23458 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
JAK1P23458 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
JAK1P23458 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
JAK1P23458 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAK1P23458 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAK1P23458 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAK1P23458 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAK1P23458 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAK1P23458 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAK1P23458 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAK1P23458 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAK1P23458 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAK1P23458 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAK1P23458 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
JAK1P23458 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
JAK1P23458 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
JAK1P23458 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
JAK1P23458 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
JAK1P23458 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
JAK1P23458 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
JAK1P23458 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
JAK1P23458 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
JAK1P23458 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
JAK1P23458 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
JAK1P23458 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
JAK1P23458 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
JAK1P23458 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
JAK1P23458 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JAK1P23458 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JAK1P23458 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
JAK1P23458 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
JAK1P23458 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms