Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA1P23193 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA1P23193 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms