Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P22392 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P22392 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P22392 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P22392 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P22392 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P22392 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P22392 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME2P22392 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME2P22392 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NME2P22392 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME2P22392 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NME2P22392 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME2P22392 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME2P22392 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME2P22392 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME2P22392 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME2P22392 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME2P22392 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME2P22392 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME2P22392 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NME2P22392 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME2P22392 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NME2P22392 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME2P22392 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME2P22392 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME2P22392 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME2P22392 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NME2P22392 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NME2P22392 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME2P22392 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME2P22392 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME2P22392 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME2P22392 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME2P22392 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME2P22392 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME2P22392 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME2P22392 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME2P22392 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME2P22392 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME2P22392 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME2P22392 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME2P22392 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME2P22392 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME2P22392 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME2P22392 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME2P22392 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NME2P22392 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME2P22392 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME2P22392 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME2P22392 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME2P22392 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME2P22392 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NME2P22392 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME2P22392 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME2P22392 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME2P22392 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME2P22392 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME2P22392 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME2P22392 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NME2P22392 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NME2P22392 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME2P22392 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME2P22392 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME2P22392 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME2P22392 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME2P22392 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NME2P22392 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME2P22392 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME2P22392 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME2P22392 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME2P22392 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME2P22392 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME2P22392 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME2P22392 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME2P22392 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME2P22392 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME2P22392 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME2P22392 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NME2P22392 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME2P22392 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME2P22392 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME2P22392 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME2P22392 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME2P22392 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME2P22392 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NME2P22392 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NME2P22392 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME2P22392 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME2P22392 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms