Protein–RNA interactions for Protein: P21453

S1PR1, Sphingosine 1-phosphate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR1P21453 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1PR1P21453 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR1P21453 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR1P21453 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms