Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3AP20336 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3AP20336 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3AP20336 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3AP20336 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3AP20336 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3AP20336 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3AP20336 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3AP20336 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3AP20336 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3AP20336 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3AP20336 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3AP20336 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3AP20336 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3AP20336 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3AP20336 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3AP20336 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3AP20336 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB3AP20336 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3AP20336 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3AP20336 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3AP20336 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3AP20336 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3AP20336 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3AP20336 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3AP20336 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3AP20336 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3AP20336 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB3AP20336 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3AP20336 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms