Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMY2BP19961 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMY2BP19961 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms