Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VCAM1P19320 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VCAM1P19320 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VCAM1P19320 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms