Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFRAP16234 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFRAP16234 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms