Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB1P14653 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB1P14653 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB1P14653 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms