Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCSHP14314 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKCSHP14314 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms