Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG2P13727 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG2P13727 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG2P13727 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG2P13727 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG2P13727 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG2P13727 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG2P13727 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRG2P13727 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG2P13727 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG2P13727 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG2P13727 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG2P13727 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG2P13727 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG2P13727 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG2P13727 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG2P13727 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG2P13727 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG2P13727 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG2P13727 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG2P13727 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG2P13727 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG2P13727 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG2P13727 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG2P13727 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG2P13727 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG2P13727 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRG2P13727 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRG2P13727 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRG2P13727 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG2P13727 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG2P13727 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG2P13727 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG2P13727 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG2P13727 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG2P13727 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG2P13727 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG2P13727 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG2P13727 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG2P13727 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG2P13727 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG2P13727 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG2P13727 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG2P13727 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG2P13727 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG2P13727 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG2P13727 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG2P13727 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG2P13727 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG2P13727 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG2P13727 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG2P13727 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG2P13727 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG2P13727 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG2P13727 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG2P13727 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG2P13727 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG2P13727 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG2P13727 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG2P13727 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG2P13727 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRG2P13727 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG2P13727 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG2P13727 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG2P13727 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG2P13727 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG2P13727 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG2P13727 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG2P13727 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG2P13727 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG2P13727 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG2P13727 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG2P13727 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG2P13727 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG2P13727 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG2P13727 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG2P13727 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG2P13727 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG2P13727 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG2P13727 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG2P13727 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG2P13727 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG2P13727 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG2P13727 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG2P13727 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG2P13727 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG2P13727 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG2P13727 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG2P13727 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG2P13727 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms