Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A3P13637 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP1A3P13637 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A3P13637 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A3P13637 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms