Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYF5P13349 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYF5P13349 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYF5P13349 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYF5P13349 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYF5P13349 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYF5P13349 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYF5P13349 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYF5P13349 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYF5P13349 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYF5P13349 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYF5P13349 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYF5P13349 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYF5P13349 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYF5P13349 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYF5P13349 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYF5P13349 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYF5P13349 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYF5P13349 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYF5P13349 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYF5P13349 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYF5P13349 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYF5P13349 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYF5P13349 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYF5P13349 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYF5P13349 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MYF5P13349 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYF5P13349 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYF5P13349 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYF5P13349 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYF5P13349 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MYF5P13349 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYF5P13349 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYF5P13349 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYF5P13349 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYF5P13349 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYF5P13349 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYF5P13349 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYF5P13349 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYF5P13349 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYF5P13349 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYF5P13349 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYF5P13349 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYF5P13349 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYF5P13349 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYF5P13349 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYF5P13349 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF5P13349 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF5P13349 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF5P13349 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF5P13349 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF5P13349 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF5P13349 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF5P13349 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF5P13349 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF5P13349 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF5P13349 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF5P13349 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF5P13349 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF5P13349 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF5P13349 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF5P13349 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF5P13349 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF5P13349 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF5P13349 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYF5P13349 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYF5P13349 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYF5P13349 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYF5P13349 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYF5P13349 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYF5P13349 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYF5P13349 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYF5P13349 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYF5P13349 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYF5P13349 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYF5P13349 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYF5P13349 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYF5P13349 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MYF5P13349 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MYF5P13349 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYF5P13349 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYF5P13349 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF5P13349 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF5P13349 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF5P13349 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF5P13349 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF5P13349 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF5P13349 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF5P13349 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYF5P13349 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms