Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BMP3P12645 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BMP3P12645 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BMP3P12645 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BMP3P12645 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BMP3P12645 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BMP3P12645 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BMP3P12645 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BMP3P12645 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BMP3P12645 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BMP3P12645 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BMP3P12645 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BMP3P12645 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BMP3P12645 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BMP3P12645 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BMP3P12645 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BMP3P12645 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BMP3P12645 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BMP3P12645 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BMP3P12645 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BMP3P12645 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BMP3P12645 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BMP3P12645 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BMP3P12645 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BMP3P12645 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BMP3P12645 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BMP3P12645 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BMP3P12645 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BMP3P12645 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BMP3P12645 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BMP3P12645 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BMP3P12645 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BMP3P12645 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BMP3P12645 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BMP3P12645 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BMP3P12645 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BMP3P12645 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BMP3P12645 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BMP3P12645 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BMP3P12645 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BMP3P12645 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BMP3P12645 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BMP3P12645 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BMP3P12645 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BMP3P12645 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BMP3P12645 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BMP3P12645 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BMP3P12645 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BMP3P12645 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BMP3P12645 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BMP3P12645 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BMP3P12645 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BMP3P12645 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BMP3P12645 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BMP3P12645 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BMP3P12645 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BMP3P12645 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BMP3P12645 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BMP3P12645 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BMP3P12645 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BMP3P12645 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BMP3P12645 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BMP3P12645 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BMP3P12645 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BMP3P12645 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BMP3P12645 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BMP3P12645 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
BMP3P12645 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BMP3P12645 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BMP3P12645 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BMP3P12645 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BMP3P12645 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BMP3P12645 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BMP3P12645 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BMP3P12645 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BMP3P12645 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BMP3P12645 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BMP3P12645 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BMP3P12645 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BMP3P12645 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BMP3P12645 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BMP3P12645 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BMP3P12645 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BMP3P12645 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BMP3P12645 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BMP3P12645 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BMP3P12645 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BMP3P12645 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BMP3P12645 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BMP3P12645 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BMP3P12645 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BMP3P12645 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BMP3P12645 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BMP3P12645 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BMP3P12645 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BMP3P12645 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BMP3P12645 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BMP3P12645 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BMP3P12645 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BMP3P12645 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms