Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RLBP1P12271 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RLBP1P12271 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RLBP1P12271 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RLBP1P12271 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RLBP1P12271 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms