Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRSS56P0CW18 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRSS56P0CW18 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRSS56P0CW18 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRSS56P0CW18 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRSS56P0CW18 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRSS56P0CW18 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRSS56P0CW18 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRSS56P0CW18 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms