Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR35P0CG20 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRR35P0CG20 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR35P0CG20 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms