Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOP08100 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOP08100 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOP08100 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOP08100 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOP08100 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOP08100 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOP08100 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOP08100 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOP08100 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOP08100 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOP08100 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOP08100 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOP08100 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHOP08100 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHOP08100 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHOP08100 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHOP08100 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHOP08100 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHOP08100 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHOP08100 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOP08100 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOP08100 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOP08100 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOP08100 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOP08100 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOP08100 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOP08100 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOP08100 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOP08100 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOP08100 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOP08100 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOP08100 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOP08100 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOP08100 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOP08100 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOP08100 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOP08100 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOP08100 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOP08100 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOP08100 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOP08100 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOP08100 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOP08100 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOP08100 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOP08100 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOP08100 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOP08100 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOP08100 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOP08100 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOP08100 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOP08100 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOP08100 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOP08100 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOP08100 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOP08100 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOP08100 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOP08100 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOP08100 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOP08100 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOP08100 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOP08100 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOP08100 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOP08100 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOP08100 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOP08100 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOP08100 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOP08100 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOP08100 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOP08100 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOP08100 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOP08100 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOP08100 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOP08100 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOP08100 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOP08100 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOP08100 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOP08100 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOP08100 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOP08100 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOP08100 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOP08100 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOP08100 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOP08100 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOP08100 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOP08100 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOP08100 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOP08100 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOP08100 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOP08100 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOP08100 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOP08100 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOP08100 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOP08100 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOP08100 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOP08100 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOP08100 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOP08100 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOP08100 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOP08100 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms