Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAPBO95292 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAPBO95292 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAPBO95292 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAPBO95292 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAPBO95292 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAPBO95292 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAPBO95292 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAPBO95292 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAPBO95292 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAPBO95292 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAPBO95292 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAPBO95292 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAPBO95292 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAPBO95292 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAPBO95292 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAPBO95292 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAPBO95292 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAPBO95292 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAPBO95292 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAPBO95292 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAPBO95292 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAPBO95292 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAPBO95292 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAPBO95292 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAPBO95292 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAPBO95292 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VAPBO95292 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAPBO95292 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VAPBO95292 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAPBO95292 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAPBO95292 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VAPBO95292 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAPBO95292 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAPBO95292 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAPBO95292 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAPBO95292 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAPBO95292 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAPBO95292 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAPBO95292 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAPBO95292 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VAPBO95292 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAPBO95292 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAPBO95292 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAPBO95292 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAPBO95292 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAPBO95292 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAPBO95292 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAPBO95292 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VAPBO95292 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAPBO95292 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAPBO95292 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAPBO95292 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAPBO95292 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VAPBO95292 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VAPBO95292 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAPBO95292 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAPBO95292 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAPBO95292 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAPBO95292 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAPBO95292 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAPBO95292 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAPBO95292 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAPBO95292 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAPBO95292 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAPBO95292 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAPBO95292 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAPBO95292 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAPBO95292 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAPBO95292 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAPBO95292 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAPBO95292 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAPBO95292 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAPBO95292 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAPBO95292 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAPBO95292 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VAPBO95292 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAPBO95292 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VAPBO95292 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAPBO95292 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAPBO95292 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAPBO95292 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAPBO95292 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAPBO95292 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAPBO95292 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAPBO95292 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAPBO95292 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAPBO95292 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms