Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPXO76031 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPXO76031 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPXO76031 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPXO76031 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPXO76031 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPXO76031 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPXO76031 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPXO76031 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPXO76031 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPXO76031 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPXO76031 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPXO76031 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPXO76031 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPXO76031 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPXO76031 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPXO76031 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPXO76031 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPXO76031 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPXO76031 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPXO76031 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPXO76031 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPXO76031 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPXO76031 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLPXO76031 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLPXO76031 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLPXO76031 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLPXO76031 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPXO76031 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPXO76031 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPXO76031 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPXO76031 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPXO76031 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPXO76031 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPXO76031 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPXO76031 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPXO76031 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPXO76031 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPXO76031 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPXO76031 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPXO76031 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPXO76031 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPXO76031 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPXO76031 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPXO76031 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPXO76031 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPXO76031 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPXO76031 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPXO76031 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPXO76031 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPXO76031 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPXO76031 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPXO76031 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPXO76031 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPXO76031 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPXO76031 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPXO76031 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPXO76031 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPXO76031 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPXO76031 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPXO76031 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPXO76031 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPXO76031 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPXO76031 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPXO76031 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPXO76031 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPXO76031 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPXO76031 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPXO76031 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPXO76031 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPXO76031 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPXO76031 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPXO76031 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPXO76031 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPXO76031 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPXO76031 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPXO76031 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPXO76031 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPXO76031 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPXO76031 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPXO76031 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPXO76031 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPXO76031 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPXO76031 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPXO76031 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPXO76031 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPXO76031 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPXO76031 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPXO76031 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPXO76031 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLPXO76031 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPXO76031 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPXO76031 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPXO76031 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPXO76031 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPXO76031 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPXO76031 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPXO76031 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPXO76031 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPXO76031 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms