Protein–RNA interactions for Protein: O75569

PRKRA, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRAO75569 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKRAO75569 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKRAO75569 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.4 ms