Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KATNA1O75449 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KATNA1O75449 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KATNA1O75449 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms