Protein–RNA interactions for Protein: O75382

TRIM3, Tripartite motif-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM3O75382 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM3O75382 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM3O75382 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM3O75382 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms