Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG13O75143 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG13O75143 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG13O75143 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG13O75143 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG13O75143 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG13O75143 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG13O75143 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG13O75143 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG13O75143 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG13O75143 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG13O75143 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG13O75143 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG13O75143 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG13O75143 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG13O75143 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG13O75143 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG13O75143 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG13O75143 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG13O75143 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG13O75143 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG13O75143 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG13O75143 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG13O75143 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG13O75143 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG13O75143 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG13O75143 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG13O75143 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG13O75143 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG13O75143 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG13O75143 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG13O75143 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG13O75143 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG13O75143 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG13O75143 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG13O75143 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG13O75143 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG13O75143 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG13O75143 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG13O75143 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG13O75143 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG13O75143 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG13O75143 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG13O75143 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG13O75143 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG13O75143 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG13O75143 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG13O75143 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG13O75143 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG13O75143 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG13O75143 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG13O75143 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG13O75143 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG13O75143 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG13O75143 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG13O75143 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG13O75143 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG13O75143 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG13O75143 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG13O75143 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG13O75143 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG13O75143 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG13O75143 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG13O75143 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG13O75143 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG13O75143 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG13O75143 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG13O75143 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG13O75143 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG13O75143 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG13O75143 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG13O75143 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG13O75143 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG13O75143 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG13O75143 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATG13O75143 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATG13O75143 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATG13O75143 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG13O75143 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG13O75143 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG13O75143 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG13O75143 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG13O75143 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG13O75143 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG13O75143 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG13O75143 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG13O75143 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG13O75143 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG13O75143 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG13O75143 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG13O75143 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG13O75143 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG13O75143 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG13O75143 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG13O75143 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG13O75143 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG13O75143 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG13O75143 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG13O75143 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG13O75143 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms