Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPR1O60356 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms