Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR3O43761 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR3O43761 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR3O43761 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms