Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BUD23O43709 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BUD23O43709 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BUD23O43709 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BUD23O43709 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BUD23O43709 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BUD23O43709 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BUD23O43709 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BUD23O43709 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BUD23O43709 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BUD23O43709 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BUD23O43709 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BUD23O43709 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BUD23O43709 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BUD23O43709 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BUD23O43709 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BUD23O43709 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BUD23O43709 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BUD23O43709 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BUD23O43709 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BUD23O43709 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BUD23O43709 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BUD23O43709 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BUD23O43709 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BUD23O43709 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BUD23O43709 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
BUD23O43709 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BUD23O43709 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BUD23O43709 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BUD23O43709 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BUD23O43709 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BUD23O43709 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BUD23O43709 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BUD23O43709 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BUD23O43709 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BUD23O43709 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BUD23O43709 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BUD23O43709 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BUD23O43709 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BUD23O43709 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BUD23O43709 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BUD23O43709 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BUD23O43709 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BUD23O43709 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BUD23O43709 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BUD23O43709 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BUD23O43709 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BUD23O43709 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BUD23O43709 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BUD23O43709 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BUD23O43709 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BUD23O43709 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BUD23O43709 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BUD23O43709 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BUD23O43709 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BUD23O43709 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BUD23O43709 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BUD23O43709 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BUD23O43709 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BUD23O43709 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BUD23O43709 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BUD23O43709 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BUD23O43709 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BUD23O43709 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BUD23O43709 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BUD23O43709 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BUD23O43709 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BUD23O43709 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BUD23O43709 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BUD23O43709 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BUD23O43709 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BUD23O43709 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BUD23O43709 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BUD23O43709 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BUD23O43709 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BUD23O43709 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BUD23O43709 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BUD23O43709 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BUD23O43709 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BUD23O43709 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BUD23O43709 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms