Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOCS1O15524 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOCS1O15524 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOCS1O15524 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOCS1O15524 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOCS1O15524 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOCS1O15524 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOCS1O15524 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms