Protein–RNA interactions for Protein: O15126

SCAMP1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1O15126 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP1O15126 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAMP1O15126 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP1O15126 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms