Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLGNO14967 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLGNO14967 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLGNO14967 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLGNO14967 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLGNO14967 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLGNO14967 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLGNO14967 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLGNO14967 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLGNO14967 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLGNO14967 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLGNO14967 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLGNO14967 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLGNO14967 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLGNO14967 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLGNO14967 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLGNO14967 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLGNO14967 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLGNO14967 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLGNO14967 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLGNO14967 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLGNO14967 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLGNO14967 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLGNO14967 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLGNO14967 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLGNO14967 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLGNO14967 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLGNO14967 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLGNO14967 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLGNO14967 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLGNO14967 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLGNO14967 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLGNO14967 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLGNO14967 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLGNO14967 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLGNO14967 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLGNO14967 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLGNO14967 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLGNO14967 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLGNO14967 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLGNO14967 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLGNO14967 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLGNO14967 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLGNO14967 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLGNO14967 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLGNO14967 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLGNO14967 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLGNO14967 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLGNO14967 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLGNO14967 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLGNO14967 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLGNO14967 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLGNO14967 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLGNO14967 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLGNO14967 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLGNO14967 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLGNO14967 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLGNO14967 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLGNO14967 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLGNO14967 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLGNO14967 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLGNO14967 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLGNO14967 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLGNO14967 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLGNO14967 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLGNO14967 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLGNO14967 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLGNO14967 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLGNO14967 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLGNO14967 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLGNO14967 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLGNO14967 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLGNO14967 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLGNO14967 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLGNO14967 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLGNO14967 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLGNO14967 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLGNO14967 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLGNO14967 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLGNO14967 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLGNO14967 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLGNO14967 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLGNO14967 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLGNO14967 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLGNO14967 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLGNO14967 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLGNO14967 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLGNO14967 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLGNO14967 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLGNO14967 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLGNO14967 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLGNO14967 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLGNO14967 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLGNO14967 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLGNO14967 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLGNO14967 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLGNO14967 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLGNO14967 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLGNO14967 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLGNO14967 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms