Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN9O14815 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN9O14815 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN9O14815 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms