Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
APAF1O14727 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
APAF1O14727 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
APAF1O14727 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
APAF1O14727 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
APAF1O14727 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
APAF1O14727 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
APAF1O14727 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
APAF1O14727 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
APAF1O14727 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
APAF1O14727 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
APAF1O14727 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
APAF1O14727 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
APAF1O14727 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
APAF1O14727 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
APAF1O14727 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
APAF1O14727 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
APAF1O14727 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
APAF1O14727 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
APAF1O14727 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
APAF1O14727 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
APAF1O14727 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
APAF1O14727 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
APAF1O14727 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
APAF1O14727 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
APAF1O14727 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
APAF1O14727 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
APAF1O14727 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
APAF1O14727 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
APAF1O14727 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
APAF1O14727 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
APAF1O14727 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
APAF1O14727 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
APAF1O14727 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
APAF1O14727 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
APAF1O14727 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
APAF1O14727 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
APAF1O14727 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
APAF1O14727 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
APAF1O14727 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
APAF1O14727 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
APAF1O14727 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
APAF1O14727 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
APAF1O14727 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
APAF1O14727 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
APAF1O14727 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
APAF1O14727 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
APAF1O14727 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
APAF1O14727 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
APAF1O14727 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
APAF1O14727 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
APAF1O14727 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
APAF1O14727 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
APAF1O14727 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
APAF1O14727 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
APAF1O14727 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
APAF1O14727 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
APAF1O14727 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
APAF1O14727 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
APAF1O14727 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
APAF1O14727 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
APAF1O14727 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
APAF1O14727 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
APAF1O14727 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
APAF1O14727 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
APAF1O14727 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
APAF1O14727 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
APAF1O14727 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
APAF1O14727 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
APAF1O14727 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
APAF1O14727 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
APAF1O14727 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
APAF1O14727 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
APAF1O14727 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
APAF1O14727 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
APAF1O14727 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
APAF1O14727 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
APAF1O14727 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
APAF1O14727 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
APAF1O14727 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
APAF1O14727 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
APAF1O14727 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
APAF1O14727 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
APAF1O14727 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
APAF1O14727 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
APAF1O14727 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
APAF1O14727 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
APAF1O14727 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
APAF1O14727 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
APAF1O14727 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
APAF1O14727 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
APAF1O14727 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
APAF1O14727 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
APAF1O14727 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
APAF1O14727 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
APAF1O14727 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
APAF1O14727 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
APAF1O14727 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
APAF1O14727 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
APAF1O14727 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms