Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TXNDC9O14530 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC9O14530 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms