Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA4O00629 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA4O00629 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms