Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGRNO00468 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGRNO00468 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGRNO00468 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGRNO00468 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGRNO00468 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGRNO00468 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AGRNO00468 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGRNO00468 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGRNO00468 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGRNO00468 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGRNO00468 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGRNO00468 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGRNO00468 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGRNO00468 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGRNO00468 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGRNO00468 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGRNO00468 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGRNO00468 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGRNO00468 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGRNO00468 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGRNO00468 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGRNO00468 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGRNO00468 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGRNO00468 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGRNO00468 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGRNO00468 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGRNO00468 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGRNO00468 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGRNO00468 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGRNO00468 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGRNO00468 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGRNO00468 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGRNO00468 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGRNO00468 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGRNO00468 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGRNO00468 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGRNO00468 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGRNO00468 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGRNO00468 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGRNO00468 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGRNO00468 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGRNO00468 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGRNO00468 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGRNO00468 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGRNO00468 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGRNO00468 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AGRNO00468 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGRNO00468 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AGRNO00468 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AGRNO00468 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AGRNO00468 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGRNO00468 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGRNO00468 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGRNO00468 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGRNO00468 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGRNO00468 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGRNO00468 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGRNO00468 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGRNO00468 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGRNO00468 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGRNO00468 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGRNO00468 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGRNO00468 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGRNO00468 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGRNO00468 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGRNO00468 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGRNO00468 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGRNO00468 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGRNO00468 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGRNO00468 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGRNO00468 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGRNO00468 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGRNO00468 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGRNO00468 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AGRNO00468 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGRNO00468 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGRNO00468 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGRNO00468 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGRNO00468 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGRNO00468 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGRNO00468 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGRNO00468 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGRNO00468 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGRNO00468 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGRNO00468 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGRNO00468 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGRNO00468 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGRNO00468 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms