Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms