Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms