Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms