Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B4E171 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4E171 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4E171 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4E171 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4E171 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4E171 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4E171 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4E171 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4E171 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4E171 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
B4E171 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4E171 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4E171 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
B4E171 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
B4E171 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
B4E171 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B4E171 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4E171 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4E171 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B4E171 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B4E171 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
B4E171 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B4E171 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B4E171 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4E171 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4E171 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4E171 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4E171 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4E171 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
B4E171 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4E171 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4E171 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4E171 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4E171 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4E171 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4E171 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4E171 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
B4E171 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4E171 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4E171 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4E171 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4E171 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
B4E171 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4E171 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4E171 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4E171 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4E171 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4E171 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4E171 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4E171 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
B4E171 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4E171 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
B4E171 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4E171 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4E171 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4E171 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4E171 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4E171 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4E171 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4E171 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B4E171 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4E171 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4E171 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4E171 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4E171 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4E171 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
B4E171 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4E171 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
B4E171 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4E171 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4E171 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4E171 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4E171 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4E171 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4E171 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4E171 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4E171 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4E171 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4E171 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4E171 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4E171 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
B4E171 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4E171 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4E171 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4E171 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4E171 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4E171 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4E171 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
B4E171 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms