Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4DLN1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4DLN1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4DLN1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4DLN1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
B4DLN1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4DLN1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4DLN1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4DLN1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4DLN1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4DLN1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4DLN1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
B4DLN1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
B4DLN1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
B4DLN1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
B4DLN1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
B4DLN1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
B4DLN1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
B4DLN1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
B4DLN1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
B4DLN1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
B4DLN1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
B4DLN1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
B4DLN1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
B4DLN1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
B4DLN1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4DLN1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4DLN1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4DLN1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4DLN1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4DLN1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
B4DLN1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
B4DLN1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
B4DLN1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
B4DLN1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
B4DLN1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
B4DLN1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
B4DLN1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
B4DLN1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
B4DLN1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
B4DLN1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
B4DLN1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
B4DLN1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
B4DLN1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
B4DLN1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
B4DLN1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4DLN1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4DLN1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4DLN1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4DLN1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4DLN1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4DLN1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
B4DLN1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4DLN1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4DLN1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4DLN1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4DLN1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
B4DLN1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4DLN1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4DLN1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4DLN1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4DLN1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4DLN1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
B4DLN1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
B4DLN1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
B4DLN1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
B4DLN1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
B4DLN1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
B4DLN1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
B4DLN1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
B4DLN1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
B4DLN1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
B4DLN1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
B4DLN1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
B4DLN1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
B4DLN1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
B4DLN1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
B4DLN1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4DLN1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4DLN1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4DLN1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4DLN1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4DLN1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4DLN1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
B4DLN1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4DLN1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4DLN1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
B4DLN1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
B4DLN1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
B4DLN1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
B4DLN1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
B4DLN1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
B4DLN1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
B4DLN1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
B4DLN1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4DLN1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4DLN1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4DLN1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4DLN1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4DLN1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms