Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PP2D1A8MPX8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PP2D1A8MPX8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PP2D1A8MPX8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PP2D1A8MPX8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PP2D1A8MPX8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PP2D1A8MPX8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PP2D1A8MPX8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PP2D1A8MPX8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms